儲存于高燥清潔的倉間內。相對濕度保持在75%以下。遠離火種、熱源。包裝須密封，切勿受潮。應與易燃、可燃物，堿類等分開存放。不可混儲混運，五氧化二磷除了易吸水，其它穩定性特高，惰性特大，因此并不存在很大的安全問題，只要密封保存就好。

五氧化二磷因能溶于水，放出大量的熱，也會在空氣中吸濕潮解，與有機物接觸還會發生燃燒。受熱或遇水分解放熱，放出有毒的腐蝕性煙氣，具有強腐蝕性。所以在包裝時還是需要對包裝室進行除濕防潮控溫。

五氧化二磷要儲存在較為干燥清潔的倉庫內，因其的特殊性質，相對濕度保持在55%以下。遠離火種、熱源。包裝須密封，切勿受潮。應與易燃、可燃物，堿類等分開存放。不可混儲混運。搬運時要輕裝輕卸，防止包裝及容器損壞，雨天不宜運輸。